อะไรคือความแตกต่างระหว่าง 16s rRNA และ 18s RRNA?

2024 ผู้เขียน: Miles Stephen | [email protected]. แก้ไขล่าสุด: 2023-12-15 23:41

หลัก ความแตกต่างระหว่าง ทำการวิเคราะห์ด้วย 18S rRNA ข้อมูลยีนแทน 16S rRNA ข้อมูลยีน (หรือข้อมูล ITS) เป็นฐานข้อมูลอ้างอิงที่ใช้สำหรับการเลือก OTU การกำหนดอนุกรมวิธาน และการสร้างการจัดตำแหน่งตามเทมเพลต เนื่องจากต้องมีลำดับยูคาริโอต

เมื่อพิจารณาถึงเรื่องนี้ เหตุใดจึงใช้ยีน rRNA 16s เพื่อระบุตัวตน

NS ยีน RNA ไรโบโซม 16S รหัสสำหรับองค์ประกอบ RNA ของหน่วยย่อย 30S ของไรโบโซมของแบคทีเรีย เนื่องจากความซับซ้อนของ DNA-DNA hybridization ยีน 16S rRNA ลำดับคือ ใช้แล้ว เป็นเครื่องมือในการ แยกแยะ แบคทีเรียในระดับสปีชีส์และช่วยในการแยกความแตกต่างระหว่างสปีชีส์ของแบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด [8]

นอกจากนี้ ยูคาริโอตมี 16s rRNA หรือไม่ NS 16S rRNA ยีนมีอยู่ในแบคทีเรียทั้งหมด และรูปแบบที่เกี่ยวข้องเกิดขึ้นในทุกเซลล์ รวมทั้งเซลล์ของ ยูคาริโอต.

คำถามก็คือ 18s และ 28s rRNA คืออะไร?

NS 28S / 18S ไรโบโซม RNA อัตราส่วนนี้มักใช้ในการประเมินคุณภาพของ RNA ทั้งหมดที่ทำให้บริสุทธิ์จากตัวอย่างที่กำหนด ในมนุษย์ 28S rRNA มี ~5070 นิวคลีโอไทด์และ 18S มีนิวคลีโอไทด์ 1869 ซึ่งให้ 28S / 18S อัตราส่วน ~2.7 สูง 28S / 18S อัตราส่วนเป็นข้อบ่งชี้ว่า RNA ที่บริสุทธิ์นั้นไม่บุบสลายและไม่เสื่อมสลาย

การจัดลำดับ 16s rRNA คืออะไร?

16S rRNA ยีน ลำดับ การวิเคราะห์เป็นวิธีการมาตรฐานในอนุกรมวิธานและการระบุแบคทีเรีย โดยอาศัยการตรวจหา ลำดับ ความแตกต่าง (พหุสัณฐาน) ในบริเวณที่แปรผันได้สูงของ 16S rRNA ยีนที่มีอยู่ในแบคทีเรียทั้งหมด